El RNA-seq es una tecnología basada en secuenciación masiva que permite estudiar qué genes están activos en una célula o tejido en un momento determinado. A diferencia del ADN, que contiene toda la información genética, el ARN refleja qué instrucciones se están utilizando realmente. Esto convierte al RNA-seq en una herramienta clave para entender procesos biológicos complejos, identificar biomarcadores o analizar la respuesta a tratamientos.

Desde el punto de vista técnico, el flujo de trabajo incluye la extracción del ARN, su conversión a ADN complementario, la secuenciación de millones de fragmentos y, finalmente, el análisis bioinformático 💻. Este análisis implica control de calidad, alineamiento a un genoma de referencia, cuantificación de la expresión y estudios de expresión diferencial y enriquecimiento funcional.

Para facilitar este proceso, soluciones como RNASeq, dentro de la suite GPRO, integran en una aplicación de escritorio la gestión y ejecución de pipelines completos de análisis. Esta herramienta está conectada a una infraestructura de servidor que incluye bases de datos, herramientas y dependencias distribuidas en contenedores, lo que permite instalar el entorno tanto en servidores remotos como en equipos con suficiente capacidad de memoria. Además, incorpora sistemas de transferencia de archivos (FTP), seguimiento de trabajos (job tracking) y distintos modos de ejecución: uno paso a paso y otro completamente automatizado tipo pipeline 🚀. Consulta el manual de la aplicación.

En conjunto, el RNA-seq no es solo una técnica experimental, sino un ecosistema de análisis donde biología y computación trabajan de forma integrada. Con la infraestructura adecuada, se convierte en una plataforma potente y reproducible para transformar datos de expresión génica en resultados sólidos y accionables.