RNASeq
RNASeq es una aplicación de escritorio cliente proporcionada por la suite GPRO, diseñada específicamente para gestionar y ejecutar procesos y flujos de trabajo para el análisis de expresión diferencial y enriquecimiento basados en datos RNASeq, utilizando un protocolo basado en la tecnología más avanzada. La aplicación se combina con una infraestructura de dependencias del lado del servidor (procesos, bases de datos y herramientas) que distribuimos en un contenedor que se puede instalar en un servidor remoto o en un PC con suficiente RAM. La aplicación también incluye un sistema de protocolo de transferencia de archivos (FTP) para facilitar la carga y descarga de archivos desde el ordenador del usuario al servidor o viceversa; un rastreador de progreso (sistema de seguimiento de tareas) y dos modos de ejecución diferentes (un modo "step-by-step" y un modo "pipeline-like").
Cítanos
Si quieres citar RNASeq:
Hafez, A. I., Soriano, B., Elsayed, A. A., Futami, R., Ceprian, R., Ramos-Ruiz, R., Martinez, G., Roig, F. J., Torres-Font, M. A., Naya-Catala, F., Calduch-Giner, J. A., Trilla-Fuertes, L., Gamez-Pozo, A., Arnau, V., Sempere-Luna, J. M., Perez-Sanchez, J., Gabaldon, T., & Llorens, C. (2023). Client Applications and Server-Side Docker for Management of RNASeq and/or VariantSeq Workflows and Pipelines of the GPRO Suite. Genes, 14(2), 267. https://doi.org/10.3390/genes14020267
Si quieres citar GPRO Suite Project:
Futami R, Muñoz-Pomer A, Viu JM, Dominguez-Escribá L, Covelli L, Bernet GP, Sempere JM, Moya A, Llorens C. GPRO: the professional tool for management, functional analysis and annotation of omic sequences and databases (2011). Biotechvana Bioinformatics: 2011-SOFT3
