Worksheet
Worksheet es una aplicación de escritorio cliente proporcionada por la suite GPRO para gestionar los pasos posteriores de integración de datos, priorización y descubrimiento de conocimientos a partir de los resultados de las anotaciones ómicas. Worksheet es una cuadrícula dinámica de columnas y filas gestionada mediante un menú que permite al usuario gestionar fácilmente uno o varios conjuntos de anotaciones. El software está acoplado a la infraestructura del servidor GPRO para llamar a varias bases de datos de conocimiento desde las que Worksheet extrae las anotaciones. Worksheet también es capaz de vincular archivos fasta al archivo de anotaciones abierto por Worksheet para extraer, filtrar o priorizar secuencias según la información proporcionada por las anotaciones.
STATools es la aplicación de escritorio cliente proporcionada por la suite GPRO para gestionar una colección de scripts desarrollados en R y otros lenguajes de programación para el análisis estadístico y la representación gráfica de datos y resultados biológicos (incluidos Tests, ANOVA, Gráficos, Histogramas, Heatmaps, Diagramas de Venn, Análisis de Clústeres y Diversidad, KRONA, Redes y más). Los scripts y todas las demás dependencias del backend se pueden instalar en el PC del usuario si tiene suficiente RAM o, más adecuadamente, en un servidor remoto. El software se combina con la infraestructura del servidor, lo que proporciona al usuario una solución basada en una interfaz para gestionar fácilmente los scripts. La aplicación proporciona un menú para acceder a las interfaces y un espacio en el lado izquierdo para visualizar los resultados.
Cítanos
Si quieres citar GPRO Suite Project:
Futami R, Muñoz-Pomer A, Viu JM, Dominguez-Escribá L, Covelli L, Bernet GP, Sempere JM, Moya A, Llorens C. GPRO: the professional tool for management, functional analysis and annotation of omic sequences and databases (2011). Biotechvana Bioinformatics: 2011-SOFT3