SeqEditor
SeqEditor es un navegador de secuencias para la gestión y el análisis de secuencias de nucleótidos y proteínas de hasta 300 megabases. Esto le permite gestionar los cromosomas más grandes conocidos actualmente. SeqEditor es una versión actualizada de TIME, un antiguo editor de secuencias (Muñoz et al. 2011) también implementado como editor de secuencias en la versión anterior de GPRO (Futami et al. 2011). La nueva versión ofrece actualizaciones mejoradas de las funciones (traducción de secuencias de nucleótidos a proteínas, edición de secuencias, cambios en la geometría y orientación de las secuencias, etc.) y también proporciona nuevas utilidades para la búsqueda y el filtrado de secuencias, ORF y motivos, la gestión simultánea de múltiples archivos, el diseño de cebadores, la inferencia de métricas y mucho más.
Cítanos
Si quieres citar SeqEditor:
Hafez, A., Futami, R., Arastehfar, A., Daneshnia, F., Miguel, A., Roig, F. J., Soriano, B., Pérez-Sánchez, J., Boekhout, T., Gabaldón, T., & Llorens, C. (2021). SeqEditor: An application for primer design and sequence analysis with or without GTF/GFF files. Bioinformatics, 37(11), 1610–1612. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa903
Si quieres citar GPRO Suite Project:
Futami R, Muñoz-Pomer A, Viu JM, Dominguez-Escribá L, Covelli L, Bernet GP, Sempere JM, Moya A, Llorens C. GPRO: the professional tool for management, functional analysis and annotation of omic sequences and databases (2011). Biotechvana Bioinformatics: 2011-SOFT3
