Aplicación de escritorio para el análisis de secuencias de nucleótidos y proteínas que funciona tanto como un navegador gráfico de secuencias como un gestor de tareas multi-fasta. SeqEditor incluye un visor GTF/GFF para gestionar archivos de anotación y un conjunto de herramientas para el diseño y agrupación de cebadores.
Aplicación de escritorio para gestionar pipelines y flujos de trabajo en servidores destinados al análisis de expresión diferencial y enriquecimiento, basada en software de última generación y con dos modos de ejecución: tipo pipeline y step-by-step.
Aplicación de escritorio para gestionar pipelines y flujos de trabajo en servidores para la caracterización de SNPs e INDELs, basada en software de última generación y con dos modos de ejecución: tipo pipeline y step-by-step.
Aplicación de escritorio para gestionar pipelines y flujos de trabajo destinados al ensamblado de novo, la anotación y el análisis funcional de datos genómicos, transcriptómicos y metatranscriptómicos.
Aplicación de escritorio para el descubrimiento de conocimiento y la exploración de anotaciones ómicas.
Aplicación de escritorio para el análisis estadístico y la representación gráfica alojada en el servidor.
Próximamente disponible
Editor gráfico interactivo para visualizar, editar y personalizar árboles filogenéticos.
GPRO Suite es un proyecto bioinformático desarrollado y mantenido por Biotechvana con el objetivo de ofrecer soluciones integrales y personalizadas para el análisis de datos ómicos mediante interfaces gráficas de usuario (GUI). Su diseño combina aplicaciones de escritorio multiplataforma con una infraestructura de servidor que integra dependencias, bases de datos, scripts y software de terceros (CLI), permitiendo ejecutar, gestionar y automatizar pipelines y flujos de trabajo bioinformáticos basados en el estado del arte.
Las herramientas de GPRO Suite están orientadas a distintos ámbitos de la bioinformática, como la caracterización de novo de genomas y transcriptomas, el análisis transcriptómico, el genotipado y estudio de variantes, la anotación y edición de secuencias, la integración de datos ómicos o el análisis estadístico.
Las aplicaciones de escritorio (lado cliente) están desarrolladas en Java y pueden instalarse en los principales sistemas operativos —Windows, macOS y Linux—, mientras que la infraestructura del lado del servidor puede desplegarse tanto en la nube como en equipos locales. Gracias a este enfoque híbrido, GPRO Suite permite a los usuarios ejecutar sus análisis de forma eficiente, flexible y reproducible, adaptándose a las necesidades de cada laboratorio o proyecto.
El entorno del servidor de GPRO Suite proporciona una infraestructura robusta para ejecutar pipelines y flujos de trabajo de análisis ómico de forma remota o local. Incluye los componentes y dependencias necesarios —software de terceros, bases de datos y scripts— empaquetados en un contenedor Docker, lo que simplifica notablemente su instalación y mantenimiento.